1 蛋白质序列的检索
1.1 从 NCBI 检索蛋白质序列
http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Protein
一般来说,利用质谱数据鉴定蛋白质主要有两种方法:肽质量指纹图谱(PMF)和肽序列标签分析(sequence tag analysis)。这两种方法较传统的 N 端测序或内部 Edman 测序法敏感数百倍,其检测低限为飞摩尔(fmol)水平(如银染的 2D胶点或 1D 胶带)。
样品制备是双向电泳中最关键的一步,将直接影响 2-DE 结果好坏。目前并没有一个通用的样品制备方法,尽管处理方法多种多样,但都遵循几个基本的原则:1)尽可能的提高样品蛋白的溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的损失;2)减少对蛋白质的人为修饰;3)破坏蛋白质与其他生物大分子的相互作用,并使蛋白质处于完全变性状态。
收集细胞。将培养瓶置于冰上,倒掉培养基,用PBS 或生理盐水漂洗两次,留适量液体于瓶内,然后用特制的细胞刮棒朝一个方向刮取细胞。将细胞悬液转移到离心管,离心取沉淀,-800C 保存。(收集细胞要迅 速 ,
组织病理技术组织处理:1.取新鲜组织厚度不超过 5mm,10% 中性福尔马林固定,大于 24 小时。2.固定后冲水 12-24 小时,3.75%酒精,1 次,1 小时,4.85%酒精,1 次,1 小时,5.95%酒精,3 次,1 小时
一、目的基因的克隆(以pshuttl-CMV质粒为例)1.选择适当酶切位点,进行酶切连接,将目的片段插入 pshuttl-CMV 质粒多克隆位点。
ELISPOT1.PBS 溶解抗原为 30 μg/ml,加 100 μl/孔于 PVDF 膜铺底的 96 孔灭菌板过夜;2. 第二天吸去包被液后,加 5%FCS 的 PRMI 1640 培养基 100 μl 封闭 1 小时,37 oC;3. 准备脾
1.将 E.coli /phage lysate 以 1:10-20 稀释在 TBST 溶液中。
2.将 4 张 82mm 的 nitrocellulose membranes(NC)浸入稀释后的 E.coli/ phage
lysate 中,室温下水平摇动 30 分钟,取出 NC 并使膜沥干。
3.用 50ml TBST 溶液洗膜 3 次,每次 10 分钟。
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