产品概述
由艾美捷代理Epigentek推出的EpiNext CUT&LUNCH(Cleavage Under Target and Liberate Unique Nucleic Complex Homogeneously)RNA 免疫沉淀(RIP)试剂盒(货号:P-2037)提供了一种快速、高效的体内蛋白质-RNA 相互作用研究方法。它整合了目前常用的 RIP 技术与改良 CUT&RUN(一种用于蛋白质-DNA 相互作用分析的新方法)的全部优势,具有以下特点:
极速三步流程:直接从完整细胞起始,无需裂解和交联。整个检测流程可在 1 小时 50 分钟内完成,最大限度减少 RNA 损伤及解离 RNA 结合组分的丢失,保留天然蛋白质-RNA 结构。
增强特异性、最小化背景:独特的核酸切割酶通过切割或去除目标蛋白/RNA 复合物两端的 RNA 序列,确保低序列偏好性,同时不影响目标蛋白占据的 RNA。游离的非特异性蛋白质-RNA 复合物被选择性清除,仅回收抗体结合的复合物。因此,可可靠地实现目标蛋白富集区域的高分辨率定位与鉴定。
低输入材料:未结合 RNA 的强力切割与免疫捕获均在同一单管中完成。该方法兼容细胞和组织样本,可最大程度保护目标蛋白并减少样本损失。输入细胞量可低至 20,000 个细胞,仅为传统 RIP 最低需求量的不到 5%。
广泛适用性:适用于培养细胞以及来自不同物种的新鲜和冷冻组织,可研究多种 RNA 结合蛋白,同时保持检测的特异性和灵敏度。
高度便捷:试剂盒包含所有必需组分,使 EpiNext CUT&LUNCH RIP 试剂盒兼具便捷性与成本效益。
背景知识
体内蛋白质复合物 RNA 的富集结合 qPCR 和/或下一代测序,是研究表观转录组范围蛋白质-RNA 相互作用的有利工具。长期以来用于实现该目标的主要方法是传统 RIP(RNA 免疫沉淀)结合 PCR(RIP-PCR)或测序(RIP-Seq)。这些方法虽被广泛使用,但无法实现高分辨率,需要交联,且重复性差、流程复杂。尤其耗时(8 小时至 2 天)且成本高昂。
原理与操作流程
该试剂盒提供富集 RNA 结合蛋白特异性 RNA 复合物所需的全部试剂,可通过 qRT-PCR 或 NGS 对多种细胞样本中的蛋白质-RNA 相互作用进行分析。检测中,细胞被透化处理后,与针对目标蛋白的 RIP 级抗体孵育。随后,独特的核酸切割酶混合物选择性切割目标蛋白区域侧翼的 RNA 序列,去除非特异性 RNA-蛋白质复合物,仅选择性保留抗体结合的复合物。捕获的蛋白质/RNA 复合物中的 RNA 片段经纯化后,可直接用于 qRT-PCR 或 cDNA 文库构建,以分析蛋白质与 RNA 之间的相互作用。
起始材料
起始材料可包括多种哺乳动物细胞样本,如来自培养瓶或培养板的培养细胞、原代细胞,或从血液、体液、新鲜/冷冻组织中分离的稀有细胞群,以及从整个细胞群和胚胎细胞中分选出的特定细胞等。
应用价值
该试剂盒是研究 RNA-蛋白质相互作用的核心工具,适用于表观转录组学、RNA 结合蛋白功能研究、mRNA 加工与稳定性调控机制探索,以及疾病相关 RNA 结合蛋白异常分析。其 1 小时 50 分钟的极速流程显著优于传统 RIP 的 8 小时至 2 天,20,000 个细胞的超低起始量使其特别适合稀有细胞样本研究。无需交联和裂解的设计保留了天然蛋白质-RNA 结构,高分辨率定位能力则为下游 qRT-PCR 和 NGS 分析提供可靠数据。单管操作与完整试剂配置进一步提升了实验效率与成本效益,是蛋白质-RNA 相互作用研究的高效解决方案。

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