一、产品定位与核心用途
由艾美捷代理Epigentek推出的ChromaFlash 高灵敏ChIP试剂盒(货号 P-2027)是一款用于染色质与转录研究领域的即用型染色质免疫沉淀试剂盒,核心功能是实现蛋白质-DNA复合物的高灵敏富集。该试剂盒以染色质为输入样本,采用96孔板格式,适用于哺乳动物细胞或组织样本,可在5小时内完成从染色质输入到即用型DNA洗脱产物的全部流程,兼容ChIP-PCR、ChIP-on-chip和ChIP-seq等多种下游分析。
二、技术背景与检测意义
蛋白质-DNA相互作用在信号转导、基因转录、染色体分离、DNA复制与重组以及表观遗传沉默等细胞功能中发挥关键作用。染色质免疫沉淀(ChIP)是研究此类相互作用的有效工具,可在活细胞中检测特定蛋白质与特定基因序列的结合,并通过PCR、微芯片或测序进行分析。例如,通过ChIP-PCR可测定特定基因启动子区域甲基化组蛋白H3K9的量,而全基因组范围内的招募情况则可通过ChIP-on-chip或ChIP-seq检测。
ChIP分析要求免疫沉淀的DNA具有极低背景,才能可靠识别真正的转录因子富集区域。高背景主要源于洗涤缓冲液效力不足、交联逆转不充分、DNA片段长度不当及残留RNA干扰。为有效捕获常处于低丰度的转录因子/DNA复合物,理想的ChIP方法需兼具最高灵敏度与最低背景,并能以少量细胞或组织实现高通量富集。ChromaFlash高灵敏ChIP试剂盒正是为此设计。
三、关键性能优势
1. 超高富集比:阳性与阴性对照的富集比大于500,可有效富集高丰度蛋白质/DNA复合物,单次ChIP反应低至2,000个细胞即可完成。
2. 极低背景:优化的缓冲液与操作流程克服了导致非特异性富集的弱点,显著降低ChIP背景,提升反应的灵敏度与特异性。
3. 高效抗体捕获:采用独特的嵌合蛋白包被条孔,含最大数量IgG结合结构域,可在宽pH范围内强效结合任何IgG亚型抗体,无论单克隆还是多克隆形式,均能提高抗体选择性与捕获效率。
4. 快速便捷:全程仅需5小时,从染色质输入到即用型DNA洗脱产物,流程紧凑高效。
5. 灵活通量:96孔板格式支持手动单次反应或高通量24–48次反应,满足不同实验规模需求。
6. 下游兼容性广:洗脱DNA可直接用于ChIP-PCR、ChIP-on-chip和ChIP-seq等多种下游分析工作流。
7. 完善对照体系:包含阳性对照抗体(RNA聚合酶II)、阴性对照非免疫IgG及GAPDH引物,可验证试剂盒试剂与流程的有效性。
四、样本输入建议
起始材料可包括培养细胞、新鲜或冷冻组织等。一般每反应细胞用量为2×103至1×106,组织用量为0.5 mg至50 mg。为获得最佳制备效果,建议输入量为1–2×105细胞或10–20 mg组织;对于低丰度转录因子靶蛋白,建议输入量提高至5–6×105细胞或50–60 mg组织。
五、应用场景与总结
该试剂盒适用于转录因子结合位点鉴定、组蛋白修饰与基因启动子关联分析、表观遗传调控机制研究以及全基因组蛋白质-DNA互作图谱绘制。其高富集比、极低背景、微量样本兼容性与灵活通量设计,使其成为染色质研究中兼顾灵敏度与可靠性的高效工具,尤其适合低丰度转录因子研究和珍贵样本分析。
六、文献参考
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Zhao S et. al. (January 2025). TET1 participates in oxaliplatin-induced neuropathic pain by regulating microRNA-30b/Nav1.6. J Biol Chem. :108228.
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Hamze Sinno S et. al. (September 2024). Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells. J Clin Invest.
Xiao C et. al. (July 2024). Overcoming Cancer Persister Cells by Stabilizing the ATF4 Promoter G-quadruplex. Adv Sci (Weinh). :e2401748.

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