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EpiNext RRBS文库快速试剂盒,4小时完成,完全转化

发布者:艾美捷科技    发布时间:2025-06-23     
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EpiNext? RRBS文库快速试剂盒专为Illumina平台设计,用于制备简化代表性亚硫酸氢盐测序(RRBS)DNA文库。该试剂盒经过优化的协议和组分,允许使用亚纳克级DNA进行MSP1 DNA消化和亚硫酸氢盐转化,随后在不到4小时内完成非条形码(单重)或条形码(多重)文库构建。

 

艾美捷Epigentek-EpiNext RRBS文库快速试剂盒(#P-1069-24)具有以下优势:

创新方法:允许快速制备合适大小的富含CpG的DNA片段,并进行亚硫酸氢盐转化。亚硫酸氢盐处理后的DNA可以直接连接到接头上,从而消除了在其他RRBS方法中常见的接头连接片段断裂的可能性。

快速且简化的流程:从DNA酶消化到可直接使用的文库DNA,整个过程可在4小时内完成。

完全转化:将未甲基化的胞嘧啶完全转化为尿嘧啶(>99%),甲基化胞嘧啶错误转化为胸腺嘧啶的情况极少。

高灵敏度和效率:创新的亚硫酸氢盐DNA接头连接方法消除了片段丢失和选择偏差,使输入DNA量可低至10 ng,非常适合珍贵且有限样本的甲基化分析。该试剂盒可用于非条形码(单重)和条形码(多重)DNA文库的制备。

极其便捷:试剂盒包含DNA文库制备每个步骤所需的所有组分,足够用于MSP1消化、亚硫酸氢盐转化、连接、清洁、大小选择和文库扩增,从而实现亚硫酸氢盐DNA文库制备的简化,以获得最可靠和一致的结果。

最小偏差:超高保真扩增可实现DNA文库的高产量,并具有最小的序列偏差和低错误率。

广泛的样本适用性:起始材料可以是来自各种组织/细胞样本的基因组DNA,如新鲜和冷冻组织、培养细胞(来自烧瓶或微孔板)、显微切割样本、福尔马林固定石蜡包埋组织、活检样本、胚胎细胞、血浆/血清样本和体液样本等。

 

EpiNext RRBS文库快速试剂盒原理与流程:

该试剂盒包含从微量输入DNA生成的亚硫酸氢盐DNA直接制备文库所需的所有试剂。在此制备过程中,通过MSP1消化富集合适大小的富含CpG的DNA片段,并进行亚硫酸氢盐转化。亚硫酸氢盐处理后的DNA以单链形式存在,随后同时转化为双链DNA并连接接头。接下来,使用MQ结合珠子对连接的片段进行大小选择和纯化,最后使用高保真PCR混合液进行扩增。该流程确保从最少的起始材料中获得最大产量,并提供具有低错误率和最小偏差的文库DNA的高精度扩增。

EpiNext RRBS文库快速试剂盒

图:库片段的大小分布。使用EpiNext从人Hela DNA制备RRBS DNA文库RRBS文库快速试剂盒:输入DNA:20 ng(红色痕量),200 ng(蓝色痕量)。片段大小为160-800bps,峰值大小为320 bps。

 

起始材料:

起始材料可以是来自各种组织/细胞样本的基因组DNA,如新鲜和冷冻组织、培养细胞(来自烧瓶或微孔板)、显微切割样本、福尔马林固定石蜡包埋组织、血浆/血清、体液样本等。DNA不应经过任何先前的限制性酶消化步骤。质粒DNA可用于亚硫酸氢盐处理,无论是否经过预先线性化,因为该试剂盒允许在整个DNA亚硫酸氢盐转化过程中保持DNA的变性状态,并直接将接头连接到亚硫酸氢盐DNA上。DNA输入量可在10 ng至400 ng之间。为了获得最佳制备效果,建议输入量为200 ng。


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