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EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒-超越CUT&RUN/CHP,so easy

发布者:艾美捷科技    发布时间:2024-12-17     
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EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒是一套完整的优化试剂,专为以下目的而设计:

1、快速富集蛋白质(组蛋白或强结合转录因子)特异性DNA复合物

2、通过qPCR或下一代直接从细胞中提取蛋白质和DNA之间的相互作用

3、使用Illumina平台进行测序。

 

艾美捷EpiNext CUT&LUNCH检测试剂盒(P-2035-24)使用前需知事项:

起始材料:起始材料可以包括各种哺乳动物细胞样本,如培养瓶或培养板中的培养细胞、原代细胞、从血液、体液中分离出的稀有细胞群体、新鲜/冷冻组织以及从整个细胞群体和胚胎细胞中分选出来的特定细胞等。

细胞输入量:每个反应的细胞量可以是2 x 10^3到5 x 10^5个细胞。为了最佳制备,细胞输入量应该是2 x 10^5,尽管对于修饰组蛋白,即使只有500个细胞也可获得结果。

抗体:抗体应为ChIP级别,以便识别与DNA或其他蛋白结合的蛋白。如果您使用的抗体尚未针对ChIP进行验证,则应使用适当的对照抗体,如抗RNA聚合酶II、抗H3K4me3或抗H3K9me3,以证明这些抗体适用于ChIP。

内部对照:此试剂盒提供了CUT&LUNCH使用的阴性和阳性对照。

注意事项:为避免交叉污染,仔细地将样品或溶液滴入管中或瓶中。使用防气溶胶的移液管头,并在液体转移之间始终更换移液管头。在整个操作过程中佩戴手套。如果手套与样品接触,立即更换手套。

运输与储存:

该试剂盒分两部分运输:第一部分在常温下运输,第二部分在4°C的冷冻冰袋中运输。

收到后,请根据上表的温度要求,在避光条件下储存各组分。

注意:使用前请检查洗涤缓冲液(WB)和渗透缓冲液(PB)是否含有盐分沉淀。如果有,请在室温或37°C下短暂加热并摇动,直到盐分重新溶解。

如果储存得当,试剂盒的所有组分自发货日期起稳定6个月。

 

CUT&LUNCH检测具有以下优点和特点:

? 极快的3步协议:从完整的细胞开始,无需ConA固定。整个过程可以在1小时50分钟内完成,最小化核损伤和染色质损失,同时保持天然染色质结构。

? 提高特异性和最小化背景:独特的核酸切割酶通过选择性地在目标蛋白/DNA复合物的两端切割DNA,确保低序列偏差,不影响与蛋白结合的DNA。非特异性蛋白-DNA复合物被选择性地消除,实现目标蛋白富集区域的高分辨率映射。

? 低输入材料:在最短时间内完成强大的未结合DNA切割和免疫捕获。这种方法使用细胞和组织,同时提供目标蛋白的最大降解保护和最小样本损失。因此,输入的细胞量可以少至500个细胞。

? 广泛适用性:适用于各种物种的培养细胞以及新鲜或冷冻组织,与组蛋白和转录因子兼容,同时保持检测的特异性和灵敏度。

? 高度便捷:试剂盒包括所有必要的组分,使EpiNext? CUT&LUNCH试剂盒既方便又经济。

? 与现有流程无缝集成:富集的DNA用于NGS,可以使用现有的、经过时间考验的ChIP-seq生物信息学软件和工具进行分析。

EpiNext 富集靶蛋白/DNACUT&LUNCH检测试剂盒

图:使用EpiNext 富集靶蛋白/DNACUT&LUNCH检测试剂盒:捕获组蛋白/DNA复合物通过阳性对照抗体(H3K4me3)从200000

MCF-7细胞。非免疫性IgG用作阴性控制。富集的DNA被纯化并发出荧光通过Qubit定量或通过qPCR分析,靶向GAPDH启动子用于富集倍数比较。

 

EpiNext CUT&LUNCH 检测试剂盒pk传统 CUT&RUN/芯片

CUT&LUNCH

工作流程方便程度:方便;总共只需 19 个步骤

所需细胞数量:2,000 - 500,000

分析目标范围:适用于组蛋白、适用于TF蛋白

裂解和收集的 DNA 的特异性:稳定;不依赖于样品中所含目标分子的数量;不受目标类型和数量的影响

序列分辨率:高

负/阳性对照率 (%):5%

检测时间长度:1 小时 50 分钟

每次检测反应的价格:低

 

传统 CUT&RUN

方便:不太方便>总共 50 步

所需细胞数量:5,000 - 500,000

分析目标范围:适用于组蛋白、不适用于TF蛋白

裂解和收集的 DNA 的特异性:稳定;根据样品中所含目标分子的数量而变化、受目标类型和数量影响

序列分辨率:高

负/阳性对照率 (%):30%

检测时间长度:6 小时 - 2 天

每次检测反应的价格:高

 

芯片

方便:因不同的 ChIP 检测而异

所需细胞数量:100 - 10,000,000

分析目标范围:适用于组蛋白、适用于TF蛋白

裂解和收集的 DNA 的特异性:不适用

序列分辨率:中等

负/阳性对照率 (%):20%

检测时间长度:对于不同的 ChIP 检测,从 4 小时 - 2 天不等

每次检测反应的价格:不同


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