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突破传统 ChIP 局限!EpiNext CUT&LUNCH 试剂盒

发布者:艾美捷科技    发布时间:2025-07-07     
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EpiNext CUT&LUNCH.png

引言:当高效与精准成为科研刚需,你还在为传统方法耗时耗力而烦恼吗?

在表观遗传学研究中,解析蛋白质与 DNA 的相互作用(如组蛋白修饰、转录因子结合)是揭示基因表达调控机制的核心。然而,传统 ChIP-seq 需要百万级细胞投入、耗时数天,CUT&RUN 虽优化了样本量,却面临非特异性切割和流程复杂的挑战。如今,EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit (P-2035-24)以突破性的技术革新,重新定义蛋白 - DNA 互作研究的 “黄金标准”——1 小时 50 分钟完成从细胞到靶标富集,2000 个细胞即可启动实验,特异性超越 CUT&RUN 1.7 倍,让高分文章的数据采集不再受限于样本与时间!


一、核心技术特点(Features):三大革新重塑实验体验

1、极简三步流程,极速完成靶标富集

·无需 ConA 固定或复杂磁珠操作,直接从完整细胞开始,通过 “抗体结合 - 核酸酶切割 - 特异性回收” 三步,1 小时 50 分钟内完成蛋白 - DNA 复合物的高效捕获。

·技术亮点:独特的核酸酶混合体系仅切割靶标区域两端的 DNA,避免非特异性片段干扰,相比 CUT&RUN 省去 20 + 步骤,实验重复性显著提升。


2、超低样本投入,解锁稀有样本研究

·仅需2000-500,000 个细胞(传统 ChIP 需 100 万 +)或新鲜 / 冷冻组织,即可实现基因组 - wide 蛋白 - DNA 互作分析。

·适用场景:临床穿刺样本、胚胎细胞、循环肿瘤细胞等稀缺样本的深度研究,打破 “样本不足” 的实验瓶颈。


3、广谱兼容性与高特异性设计

·兼容组蛋白修饰(如 H3K4me3、H3K9me3)与强结合转录因子,独特酶切体系避免抗体非特异性结合导致的背景噪音。

·数据支撑:与 ENCODE 数据库 ChIP-seq 数据对比,CUT&LUNCH 的峰型更锐利、背景更低,FRiP 值(靶标区域富集率)比 CUT&RUN 高 1.7 倍,精准定位 DNA 结合位点。

 

ChIP-seq.pngCUT&LUNCH.pngEpiNext CUT&LUNCH.png
试剂盒的示意图流程CUT&LUNCH 在目标区域的信号富集度更高。CUT&LUNCH 的 FRiP 比 CUT&RUN 高 1.7 倍CUT&LUNCH 检测 0.1 百万 MCF-7 细胞组蛋白标记(H3K4me3 活跃区与 H3K9me3 沉默区)的峰谱,与 ENCODE 数据库中 5 百万 MCF-7 细胞 ChIP-seq 数据的峰分数分布高度一致。

二、技术优势:为什么 CUT&LUNCH 是优于 CUT&RUN 和 ChIP 的选择?


指标

CUT&LUNCH

传统 CUT&RUN

ChIP

流程耗时

1 小时 50 分钟

6 小时 - 2 天

4 小时 - 2 天

细胞投入量

2000-50 万

5000-50 万

10 万 - 1000 万

转录因子适用性

良好

较差(非特异性切割严重)

良好

背景噪音

5%(阴性 / 阳性对照比)

30%

20%

测序分辨率

高(单碱基级别)

中等

 

优势解析:

·相比 CUT&RUN,CUT&LUNCH 通过 “两端特异性酶切” 避免了 pAG-MNase 非偶联抗体的随机切割,尤其在转录因子研究中优势显著(如 Oct4、Sox2 等低丰度结合蛋白)。

·对比 ChIP,CUT&LUNCH 省去交联、超声破碎等损伤害染色质结构的步骤,保留天然互作状态,且无需优化超声条件,实验成功率提升 90% 以上。


三、科研价值:你的研究将因它获得哪些突破?

1、提速发文周期,抢占科研先机

·从样本处理到 NGS 建库仅需 1 天,比传统方法缩短 3-5 天,助力快速验证假设、抢占领域热点(如癌症表观调控、发育生物学基因表达动态)。

·用户案例:某高校团队使用 CUT&LUNCH 分析 2000 个胚胎干细胞的 H3K27me3 修饰,2 周内完成测序与分析,成果发表于《Nature Communications》。


2、数据质量升级,助力高分期刊发表

·高特异性富集带来更低的背景噪音和更尖锐的峰型,满足《Cell》《Science》等顶刊对测序数据 “高信噪比” 的要求。

·实验验证:MCF-7 细胞中 H3K4me3 的 CUT&LUNCH 数据与 ENCODE 标准数据一致性达 92%,且峰宽缩小 40%,证明定位精度显著提升。


3、降低实验成本,优化资源分配

·试剂盒包含所有必需试剂(抗体、核酸酶、纯化柱等),无需额外购买磁珠或酶类,单反应成本比 CUT&RUN 降低 50%。

·低样本需求减少珍贵样本浪费,尤其适合预算有限的课题组或多样本平行实验。

 

四、应用场景:从基础研究到转化医学的全场景覆盖

·表观遗传机制研究:组蛋白修饰图谱绘制、染色质开放区域分析(配合 ATAC-seq);

·转录因子调控网络:疾病相关转录因子(如 p53、NF-κB)的结合位点鉴定;

·癌症标志物筛选:肿瘤细胞中异常甲基化组蛋白的富集与测序;

·药物靶点发现:小分子化合物对蛋白 - DNA 互作的干预效果评估(如 HDAC 抑制剂作用机制)。

 

五、即刻行动:解锁你的科研效率密码

现在订购 EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit(货号 P-2035-24,24 次反应),所有产品均提供6 个月质量保证,搭配配套的 CUT&LUNCH Library Preparation Kit(货号P-1058-24,24 次反应),轻松实现从富集到测序的全流程闭环。欢迎垂询Epigentek中国区独家代理,艾美捷科技!

 

结语:让每一份样本都发挥最大价值,让每一次实验都靠近科学真相

EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit,以技术创新打破科研瓶颈,让 “高效” 与 “精准” 不再是单选题。无论你是追求高分辨率数据的资深研究者,还是初入表观领域的科研新人,它都将成为你探索基因调控奥秘的得力助手 ——你的下一篇高分论文,或许就差这个 “极速富集” 的关键工具!

 

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