Paf1(RNA聚合酶相关因子1,也称PD2)是真核生物Paf1复合物的核心亚基之一。该复合物最早在酵母中发现并与RNA聚合酶II(RNAP II)相互作用,在转录延伸、组蛋白H2B单泛素化、H3甲基化、染色质重塑以及mRNA 3’端加工等多个基因表达调控环节发挥关键作用。哺乳动物Paf1复合物参与细胞增殖、分化及肿瘤发生,其中Paf1本身在胰腺癌等多种恶性肿瘤中高表达,被视为潜在的治疗靶点。因此,准确检测Paf1的表达水平、结合蛋白及细胞内定位,对于转录调控和肿瘤机制研究至关重要。
本文所介绍的由艾美捷Bethyl Laboratories推出的兔抗Paf1多克隆抗体(货号:A300-172A)是针对人Paf1蛋白第75–125位氨基酸区域的特异性抗体,经抗原亲和纯化,适用于免疫沉淀(IP)和免疫印迹(WB),可识别人和小鼠来源的Paf1。以下从抗体规格、生产纯化、实验应用及性能特征等方面进行详细说明。
一、抗体核心规格
项目 | 具体参数
靶标 | Paf1(PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component)
反应性 | 小鼠、人
应用 | IP, WB
宿主 | 兔
克隆性 | 多克隆
形式 | 全分子IgG
免疫原 | 人Paf1第75–125位氨基酸之间的区域
亚型 | IgG
标记 | 未偶联
纯度 | 抗原亲和纯化
抗原种属 | 人
浓度 | 1000 ?g/ml(1 mg/ml)
缓冲液 | Tris-柠檬酸/磷酸缓冲液,pH 7–8,含0.09%叠氮钠
储存条件 | 2–8 °C
有效期 | 收货后1年
浓度测定方法 | Beer’s Law(A280 1.4对应1 mg/ml IgG)
抗体浓度:1 mg/ml的高浓度设计,满足IP实验需要较大抗体量(6 ?g/mg裂解液)以及WB中宽范围稀释(1:2000–1:10000)的需求。
防腐剂:含0.09%叠氮钠,可抑制微生物生长。常规IP/WB实验不受影响;如需用于活细胞或体内实验,需通过透析去除。
二、生产与纯化工艺
1. 免疫原设计
选择人Paf1蛋白序列(TrEMBL Q9NUU9,GeneID 54623)中第75–125位氨基酸之间的合成肽段作为免疫原。该区域位于蛋白质N端附近,在人和小鼠中高度保守,因此抗体可同时检测两种种属。此外,该表位不参与已知的蛋白质-蛋白质相互作用界面,有利于识别天然和变性状态的Paf1。
2. 抗血清制备
采用上述免疫原免疫兔,获得高滴度多克隆抗血清。
3. 亲和纯化
将免疫原肽段共价偶联到固相支持物(如琼脂糖凝胶)上形成亲和层析柱。抗血清通过该柱时,特异性识别该表位的抗体被捕获,经低pH洗脱后得到高纯度、高活性的全分子IgG。此过程去除了不识别靶表位的非特异性免疫球蛋白,显著降低背景。
4. 浓度与缓冲液
纯化后的抗体溶于Tris-柠檬酸/磷酸缓冲液(pH 7–8),并加入0.09%叠氮钠作为防腐剂。该缓冲体系不含EDTA或高浓度盐,适合直接用于IP和WB稀释。
特异性验证:通过肽段竞争ELISA确认抗体仅识别Paf1第75–125表位,与全长蛋白的其他区域无交叉。敲低实验(siRNA靶向PAF1)可导致WB中目标条带消失,进一步验证特异性。
三、推荐应用与实验条件
本抗体已验证适用于免疫沉淀和免疫印迹。以下为厂家推荐的实验条件及操作要点。
1. 免疫沉淀(IP)
使用量:6 ?g 抗体 / mg 细胞裂解液总蛋白。
例如:取1 mg总蛋白裂解液,加入6 ?l本抗体(浓度1 mg/ml,即6 ?l含6 ?g抗体)。
裂解液选择:推荐使用非变性裂解液,如含0.5% NP-40或0.5% Triton X-100的Tris缓冲液(pH 7.5),并添加蛋白酶抑制剂(如PMSF、cocktail)。避免使用强变性剂(如SDS)以免破坏Paf1复合物的天然构象。
操作流程:
1. 将裂解液与抗体在4°C旋转孵育2小时或过夜。
2. 加入40–50 ?l Protein A琼脂糖珠(预平衡),继续孵育1–2小时。
3. 离心(2000×g,1分钟)收集珠子,用裂解液洗涤3–5次。
4. 加入2× SDS上样缓冲液(含还原剂),95°C加热5分钟,离心后取上清进行WB检测。
阳性对照:人HeLa、293T细胞裂解液或小鼠NIH/3T3细胞裂解液。Paf1在多种细胞系中普遍表达,预期分子量约60–70 kDa(实际大小因物种和修饰略有差异)。
2. Western Blot(WB)
稀释范围:1:2000 – 1:10,000
封闭与稀释液:5%脱脂牛奶 – TBST(Tris缓冲盐水含0.1% Tween-20)。厂家指定使用5% Milk-TBST作为封闭液和抗体稀释液,不可替换为BSA或其他成分(可能影响信号强度)。
一抗孵育:4°C孵育过夜。室温短时间孵育可能导致灵敏度下降,建议严格遵循过夜条件。
二抗选择:
检测全细胞裂解液:使用山羊抗兔IgG(H+L)HRP标记抗体(如货号A120-101P),稀释度通常为1:5000–1:10000。
检测免疫沉淀产物:由于IP使用兔抗体,其重链(~55 kDa)和轻链(~25 kDa)会在WB中显影,可能与目标蛋白Paf1(~65 kDa)或普通IgG轻链带重叠。为此,厂家建议使用抗兔IgG轻链特异性HRP标记抗体(可避免重链交叉),并在封闭液中加入5%正常猪血清(货号S100-020)以降低背景。轻链抗体仅识别约25 kDa的轻链,因此不会干扰60–70 kDa目标区域的检测。
阳性对照:HeLa或293T全细胞裂解液,上样量20–50 ?g总蛋白。
3. 实验注意事项
样本制备:使用含SDS和还原剂(如DTT或β-巯基乙醇)的上样缓冲液,95°C加热5分钟。
膜类型:推荐使用PVDF膜(需甲醇活化)或硝酸纤维素膜。转膜后可用丽春红染色确认转印效果。
洗涤:TBST洗涤3次,每次5分钟,确保去除未结合抗体。
四、储存稳定性
2–8°C条件下可稳定保存1年。请勿冷冻,冷冻会导致抗体聚集和效价下降。如必须长期保存,可分装后于-80°C冻存(官方未验证此条件,但许多用户成功使用;注意避免反复冻融)。

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