EpiQuik染色质可及性检测试剂盒，培养细胞与新鲜/冷冻组织均兼容

一、背景介绍

染色质中调控元件的可及性对基因调控的多个方面至关重要。核小体若占据调控元件位置，会阻碍转录因子与 DNA 的结合。要阐明染色质与转录因子之间相互作用的功能，关键在于通过绘制基因组上核小体的定位来确定染色质可及性。一般而言，染色质越浓缩，转录因子和其他 DNA 结合蛋白就越难接近 DNA 并执行其功能；DNA 越可及，周围基因越可能处于活跃转录状态。核小体的存在与否直接或间接影响多种其他细胞与代谢过程，如重组、复制、着丝粒形成和 DNA 修复。

二、产品概述

由艾美捷代理Epigentek推出的EpiQuik染色质可及性检测试剂盒（货号：P-1047）是一套完整的优化试剂组合，专为通过实时 PCR 对多种生物样本进行基因特异性染色质可及性分析而设计，包括核小体/转录因子定位分析。该试剂盒是快速检测开放与闭合染色质的低成本、实用型工具，具有以下优势与特点：

极快且便捷：整个流程（从细胞/组织样本到可用于 PCR 的 DNA）最快可在 1 小时 30 分钟内完成。

样本兼容广：可用于培养细胞，也可用于新鲜和冷冻组织。

结构保护：快速流程最大限度减少核损伤和游离染色质组分的丢失，从而保护染色质结构。

内含对照：试剂盒包含人源内参引物，可作为分析样本 DNA 中特定基因靶标染色质可及性程度的参考，同时用于验证酶切是否成功。

灵活：可选择单反应检测或高通量多反应检测。

三、原理与操作流程

本试剂盒包含通过实时 PCR 对细胞/组织样本进行基因特异性染色质可及性分析所需的全部试剂，并内含用于判断染色质消化是否成功的内参引物。实验中，从细胞/组织中分离染色质，用核酸酶混合物处理，随后分离 DNA 并通过实时 PCR 扩增，进行区域特异性染色质可及性分析。染色质状态可根据 DNA 对核酸酶的可及性来判定：异染色质中的 DNA 对外源蛋白（包括外源核酸酶）不可及，受到核小体或 DNA/蛋白复合物保护，因此消化与未消化样本之间的 Ct 偏移不显著，仍可用于后续 PCR；相反，常染色质（核小体缺失）中的 DNA 对外源核酸酶可及，易被核酸酶消化，导致消化与未消化样本之间出现较大 Ct 偏移，从而无法用于 PCR。

四、起始材料与输入量

起始材料可包括多种哺乳动物组织或细胞样本，如培养瓶或微孔板培养细胞、新鲜和冷冻组织等。每次反应的细胞/组织用量可为 1×10⁵个细胞或 2 mg 组织至 2×10⁶ 个细胞或 40 mg 组织。为获得最佳反应效果，输入染色质量约为 0.5×10⁶ 个细胞或 10 mg 组织。

五、应用价值

该试剂盒适用于染色质结构与转录调控研究，尤其适合需要快速评估特定基因区域染色质开放程度的实验场景。通过实时 PCR 读取消化与未消化样本之间的 Ct 偏移，可灵敏区分开放与闭合染色质状态。内含的人源内参引物既可用于评估目标基因的染色质可及性，也可验证酶切效率，降低实验失败风险。单反应与高通量多反应两种模式为不同通量需求的实验室提供了灵活选择，快速流程则有助于保护染色质天然结构，提高数据可靠性。

六、文献参考

Kumar A et. al. (September 2026). A Novel Epigenetic Mechanism of Intestinal NHE3 Gene Regulation by Histone Acetylation. Int J Mol Sci. 27(18) PubMed: 42794528

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Liao W et. al. (June 2026). HDAC2-mediated H3K27ac Governs ZFP42 transcription and autophagy in granulosa cells of pigs. Life Sci. 401:124527. PubMed: 42264139

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