一、产品概述
由艾美捷代理Epigentek推出的EpiQuik 羟甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)试剂盒(货号:P-1038)是一套完整的优化缓冲液和试剂组合,可在高通量格式下,使用从任何物种提取的DNA,成功进行hMeDIP操作,选择性富集含有5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)的DNA片段。使用本试剂盒富集的羟甲基化DNA可用于多种下游应用,包括PCR(hMeDIP-PCR)和微阵列(hMeDIP-chip),以研究细胞或组织中基因特异性的羟甲基化状态。
二、关于5-羟甲基胞嘧啶
5-hmC是胞嘧啶的一种修饰形式,近期在动物组织中发现,在DNA甲基化调控、染色质重塑和基因表达(尤其是脑特异性基因调控)中发挥与5-mC重要且不同的作用。最近,5-hmC被观察到与哺乳动物受精卵的表观遗传重编程相关。然而,由于目前使用的DNA甲基化分析方法无法区分5-hmC和5-mC,导致5-hmC的基因特异性分布未知,因此其确切功能尚未完全明确。
三、产品特点
鉴于DNA中5-hmC的存在及其在基因调控中尚不明确的功能,以及产生5-hmC的酶的发现,鉴定特定基因位点的羟甲基化状态至关重要,这有助于更好地理解基于甲基化的基因功能表观遗传调控。为此,Epigentek开发了一种捕获含5-hmC DNA片段的创新方法,并将其整合至EpiQuik 羟甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)试剂盒中。该试剂盒使用高亲和力5-hmC抗体选择性捕获含有5-hmC的双链或单链DNA片段。该试剂盒具有以下特点:
极速便捷——从输入样本到即用型羟甲基化DNA的总流程时间不足3小时,其中手动操作时间少于20分钟。
灵活格式——96条孔微板格式使检测非常易于操作:可手动一次进行一个反应,或高通量一次进行96个反应。
高效富集——阳性/阴性对照富集比大于1000。
低输入量——每个反应所需DNA量低至0.1 ?g。
高重现性——通过预优化的hMeDIP条件实现高重现性。
下游兼容——兼容多种下游分析流程,包括hMeDIP-PCR和hMeDIP-chip。
四、原理与操作流程
EpiQuik 羟甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)试剂盒包含使用从哺乳动物细胞或组织提取的DNA成功进行hMeDIP操作所需的全部试剂。该试剂盒包含阳性对照DNA片段、阴性对照非免疫IgG,以及可与阳性对照配合使用的对照引物,以证明试剂盒试剂和方案对羟甲基化DNA的富集效果。含有5-hmC的阳性对照DNA可被5-hmC抗体免疫沉淀,但不被非免疫IgG沉淀。在该hMeDIP中,5-hmC富集DNA片段的免疫沉淀在微板中于优化反应条件下进行,使hMeDIP可在3小时内高效完成。免疫沉淀的羟甲基化DNA随后被清洗、释放和洗脱。洗脱的DNA可用于多种下游应用,包括PCR(hMeDIP-PCR)和微阵列(hMeDIP-chip)。
五、简便、快速与灵活
整个hMeDIP流程步骤易于遵循,兼顾便捷与速度,从DNA剪切到hMeDNA洗脱可在3小时内完成。96条孔微板格式允许手动处理(一次一个反应)或高通量处理(一次96个反应)。试剂盒包含羟甲基化DNA片段和非免疫IgG,分别作为阳性和阴性对照,用于任何物种(包括哺乳动物、植物、真菌、细菌和病毒)的羟甲基化DNA富集。
六、选择性与高富集
独特的流程和专有试剂盒组分允许从基因组DNA样本中选择性高富集羟甲基化DNA,用于基因特异性羟甲基化分析。将实时PCR与本试剂盒结合,检测到OCT4启动子区的5-hmC富集比GAPDH启动子区高110倍,表明OCT4启动子发生羟甲基化。与甲基胞嘧啶和未甲基化胞嘧啶无交叉反应,因此仅富集羟甲基化DNA(5-hmC)。
七、与MeDIP兼容
EpiQuik hMeDIP试剂盒可与MeDIP流程配合使用,同时分析特定基因位点的羟甲基化和甲基化状态。

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