ADAR1反应型荧光素酶报告基因HEK293细胞系是一种设计用来响应ADAR1酶活性的HEK293细胞系。这些细胞被改造以表达一个ADAR1报告基因构建体,包含一个ADAR1发夹靶标,其带有可被ADAR1介导编辑成色氨酸(UUG)的终止密码子(UAG),位于荧光素酶报告基因的上游(图1)。
该细胞系已通过比较转染ADAR1和ADAR2后的报告基因激活情况进行了验证。这个细胞系已被用于开发恒定表达ADAR1的ADAR1活性荧光素酶报告基因HEK293细胞系(#82239)。
图1:ADAR1反应型荧光素酶报告基因HEK293细胞系的作用机制图示。
ADAR1报告基因构建体由一个带有终止密码子(UAG)的ADAR1发夹靶标组成,位于编码荧光素酶的序列上游。在ADAR1活性存在的情况下,例如转染ADAR1时,腺嘌呤被转换成肌苷,现在编码氨基酸色氨酸(UUG),使得荧光素酶的转录和表达成为可能。在没有转染ADAR1的情况下,荧光素酶不会被转录,细胞显示背景荧光素酶活性。荧光素酶活性与ADAR1活性直接相关。
背景
ADAR(作用于RNA的腺苷脱氨酶)酶在RNA中执行腺苷到肌苷的碱基编辑,特别针对位于特定双链茎环结构(图1)中的腺苷。在健康的未感染细胞中,ADAR1对内源性双链RNA进行A到I编辑,以防止其激活下游的dsRNA传感器RIG-I(视黄酸诱导基因I)和MDA5(黑色素瘤分化相关蛋白5),进而激活促炎症反应。ADAR1功能丧失突变导致dsRNA传感器异常激活,并涉及自身免疫性疾病。ADAR1功能障碍也影响癌细胞生长、增殖和对免疫疗法的反应。ADAR1在许多肿瘤类型中表达增加,ADAR1敲除已被证明可以改善对某些免疫疗法的反应,如PD-1(程序性死亡蛋白1)/PD-L1(程序性死亡配体1)阻断,并可绕过肿瘤免疫疗法抵抗机制,使ADAR1成为治疗开发的理想靶标。
HEK293细胞内源性ADAR1表达水平低,因此这个细胞系非常适合研究ADAR1的遗传工程变体。例如,可以通过转染或转导将ADAR1变体引入细胞并比较其活性。使用荧光素酶作为报告基因允许简单的检测读出,使这个细胞系成为ADAR1研究的有吸引力的细胞系统。
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ADAR1 响应型荧光素酶报告基因 HEK293 细胞系 | BPS-82238 | 查看 |
应用
? 监测表达的ADAR1活性。
? 在细胞模型中比较ADAR1修饰和突变的活性,例如在研究ADAR1衍生物结构与功能关系以及RNA编辑疗法的研究中。
细胞复苏
1. 在37°C水浴中旋转冷冻细胞瓶大约60秒。细胞解冻后(可能比60秒稍快或稍慢),迅速将瓶内的全部内容转移到含有10毫升预热的解冻培养基1的管中。
注意:在37°C水浴中放置细胞过久会导致细胞活力迅速下降。
2. 立即以300 x g的速度离心细胞5分钟,去除培养基,并在5毫升预热的解冻培养基1中重悬细胞。
3. 将重悬的细胞转移到T25或T75培养瓶中,并在37°C、5% CO2培养箱中培养。
4. 培养24小时后,检查细胞附着和活力。更换为新鲜的解冻培养基1,并继续在37°C、5% CO2培养箱中培养,直到细胞准备好传代。
5. 在细胞完全融合之前应进行传代。在第一次传代及后续传代中,使用生长培养基1N。
细胞传代
1. 吸去培养基,用不含Ca2+/Mg2+的磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤细胞,并用0.05%胰蛋白酶/EDTA从培养容器中分离细胞。
2. 一旦细胞分离,加入生长培养基1N并转移到管中。
3. 以300 x g的速度离心细胞5分钟,去除培养基,并在生长培养基1N中重悬细胞。
4. 按推荐的亚培养比例1:5至1:10每周一次或两次播种到新的培养容器中。
细胞冷冻
1. 吸去培养基,用不含Ca2+/Mg2+的PBS洗涤细胞,并用0.05%胰蛋白酶/EDTA从培养容器中分离细胞。
2. 一旦细胞分离,加入生长培养基1N并计数细胞。
3. 以300 x g的速度离心细胞5分钟,去除培养基,并在4°C细胞冷冻培养基(BPS Bioscience #79796)中重悬细胞,浓度约为1 x 10^6细胞/毫升。
4. 将1毫升细胞悬浮液分装到每个冷冻管中。将管放入绝缘容器中缓慢冷却,并在-80°C下过夜储存。
5. 次日将管转移到液氮中进行长期储存。
注意:建议在早期传代扩展细胞并至少冷冻10管细胞以备将来使用。
验证数据
? 以下实验设计为96孔板格式。在不同的组织培养格式中进行实验时,应适当调整细胞数量和试剂体积。
? 所有条件应在三个副本中进行。
? 实验应包括“ADAR过表达”(通过转染或其他方法引入ADAR1或ADAR2的细胞),“阴性对照”(未添加ADAR1或ADAR2,模拟转染条件)和“背景发光”条件。
图2:转染不同ADAR1亚型的ADAR1反应型荧光素酶报告基因HEK293细胞系中ADAR1报告基因的反应。
细胞转染编码不同ADAR1亚型(ADAR1 p150和ADAR1 p110)或ADAR2的质粒24小时。使用One-Step?荧光素酶检测系统测量荧光素酶活性。结果表示为ADAR1荧光素酶报告基因活性的倍数诱导(与未过表达ADAR的细胞相比)。
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