可提供的Oligo级别(从科研级到GMP级)
Eurogentec自豪地推出Track寡核苷酸作为您合理定价的解决方案。凭借超过25年的寡核苷酸制造经验,Eurogentec确保提供从科研级别到商业化级别的高质量产品和服务。
Track寡核苷酸提供所需的可追溯性,包括在整个生产过程中使用的设备、参与的人员以及其他重要的制造规格。而且,所有这些都以实惠的价格!
使用Track寡核苷酸,您拥有了大多数诊断市场应用所需的可追溯性:实验室服务(健康、农业、兽医、环境)、医院实验室、农业实验室、MDx公司~
Eurogentec的Oligo在骨架、修饰、规格和纯化方面提供了广泛的选择范围。超过300种修饰和几个纯度级别可供选择。
Oligo骨架
碱基: Eurogentec 不仅提供经典的 DNA 碱基和 RNA 碱基寡核苷酸,也可以提供其他的骨架如 LNA,2’-O-Me 等满足您的需求。
LNA (锁核苷酸) 是一种双环结构的碱基,在内环 C3' 位置形成刚性的锁状结构,有利于与 RNA 形成 A 型螺旋双螺旋结构。这种特殊的结构赋予 LNA 与互补的 DNA 和 RNA 模板杂交时更强的热稳定性,适用于需要较高的特异性和/或重复性的杂交检测。
2’-O-Me RNA 可以部分耐受多种核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶。它们与互补 RNA 链形成的杂交链比 DNA/RNA 杂交链更稳定。它们是反义探针的理想选择。
2’-O-(2-甲氧基乙基) 或称2’-O-MOE 除一个类似 RNA 的化学结构,此外还有一个甲氧基乙酯附着在 2’-O 位置。在这个位置上的化学基团赋予寡核苷酸骨架最高的核酸酶抗性,以及比经典的 RNA 分子更好的结合亲和力,有助于在反义研究中的应用。
连接:
Phosphodiester——磷酸二酯键(默认连接) 连接核糖 3' 端碳原子和 5' 端碳原子。
Phosphorothioate——硫代磷酸二酯键 取代非桥氧原子的硫原子,增强了化学键的核酸酶抗性。
Methylphosphonate*——甲基磷酸二甲酯键 是非离子性核酸酶抗性的连接。甲基膦酸二甲酯/ RNA 双链不会被 RNaseH 识别。
*只适用于DNA碱基。
Oligo修饰
寡核苷酸可以在合成过程中直接添加修饰,或者在合成后进行修饰
1. 直接修饰
1)3’端修饰
由于自动寡核苷酸合成是从 3’ 端到 5’ 端的,只有在相应的固体载体(CPG柱)可用且修饰与合成过程中所用的化学物质相相容时,才有可能添加这些修饰。典型的例子是 3’phosphate,3’Biotin,3’FAM,3’DDQ I,3’BHQ-1 等。
2)5’端和中间修饰
很多修饰可以直接引入在 5' 端或通过亚磷酰胺引入到寡核苷酸的内部位置。然而这些修饰需要能够耐受某些严酷的裂解脱保护条件,包括极强的碱性 pH 值。典型的例子是 5’Biotin,5’Phosphate,5’ Cholesterol,5’FAM,8-OxodA,Biotin-dT,DABCYL-dT 等。
2. 合成后修饰
合成后的修饰可能影响反应的收率。低产量可能是由于多种修饰和/或强烈的二级结构。两大合成后反应用来引入敏感染料或不存在的亚磷酰胺化合物。在第一种情况下,标签是共轭氨基修饰的寡核苷酸(3’,5’ 或在 dT 碱基上)使用氨基反应的版本(N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS)在大多数情况下)。
第二种可能性(原来也用于分子信标的合成)是一个马来酰亚胺改性标签巯基修饰的寡核苷酸的加入。
Oligo纯化方式选择:
任何纯化方法的首要目的都是为了去除由于去保护基团和其他合成副产物而产生的杂质。请参考每种修饰的最适纯化方法。如果您不确定哪种纯化方法适合您的应用,请注明“Recommended Single Purification”(需支付额外费用),我们将为您选择最佳纯化方式。
不同修饰建议的纯化方式:
不同长度Oligo修饰建议的纯化方式:
合成规格与实际产量的关系,请参考:
额外的QC
MALDI-TOF Mass Spectrometry: 这种方法提供了广范围(最长至60个碱基)的有关长度、脱保护产品和带有修饰的寡核苷酸的标记的最准确的信息。
RP-HPLC: 这是一种非常有效的技术,它提供了从15至40个碱基的寡核苷酸纯度水平的量化信息。
IEX-HPLC: 这种技术特别适合于从15至40个碱基寡核苷酸的量化纯度水平。
Capillary Gel Electrophoresis(CGE): 这种方法适用于非常精确地评估超过40个碱基的寡核苷酸的纯度。
Fluorescence analysis: 这种非破坏性的物理技术提供了有关荧光寡核苷酸的定性信息。
MALDI-TOF Mass Spectrometry sequencing:这种方法提供了高分辨率的结果,快速的样品分离,并消除与凝胶系统相关的压缩。这是精确核酸测序的方法。
交货形式:
干粉: 所有合成的寡核苷酸默认以干粉交货。
退火: siRNA 或克隆 linkers 默认是经过退火的。
预混合: 相同量的正义链和反义链寡核苷酸可以混合包装在一个管中。
包装:
2 mL 管: 默认情况下,每条寡核苷酸都包装在单独提供的2 毫升管中。更大容积的管可以按要求运输(15毫升,50毫升)。
96-孔平板: Cluster tubes, well plate 和 deep well plate。
384-孔平板: 特别适合超过96条寡核苷酸的高通量实验的需求。
分装: 所有已溶液状态发货的寡核苷酸可以按要求分装 (从 50 ul 到 1000 ul)。
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